Pelayanan Transplantasi Organ di RSUP Dr. M. Djamil berupa Transplantasi Ginjal. Tindakan transplan ini pertama kali dilakukan pada tanggal 20 April 2015 dan hingga saat ini sudah berhasil dilakukan 21 tindakan transplantasi ginjal. Selain transplantasi ginjal, layanan uronefrologi lain yang bisa dilakukan di RSUP Dr. M. Dajamil yaitu hemodialisis, Continuous Ambulatory Peritoneal Dialysis (CAPD), Extra Corporeal Shock Wave Lithotripsy (ESWL), Percutaneus Nephrolithotomy (PCNL) dan tindakan operatif lainnya.