RSUP Dr. M. Djamil mempunyai fasilitas Rawat Inap yang dilengkapi mulai dari kelas 3, kelas 2, kelas 1, VIP B, VIP A, dan Super VIP yang terdiri dari : Instalasi Pavilun Ambun Pagi Instalasi Anestesiologi dan Terapi Intensif Instalasi Pusat Jantung Terpadu Instalasi Rawat Bedah Instalasi Rawat Non Bedah Instalasi Rawat Inap Kebidanan & Anak